Il controllo sull'uso dei farmaci veterinari - che sono sempre del tutto diversi dai farmaci per uso umano - è uno dei compiti più importanti che il servizio veterinario svolge, ed è finalizzsato ad evitare che negli alimenti di origine animale, in particolare carni e latte e uova, siano presenti molecole farmacologicamente attive che possono determinare inconvenienti anche seri nella persona che consuma tali alimenti inquinati.
I farmaci veterinari sono venduti esclusivamente dietro presentazione di ricetta veterinaria in più copie, una delle quali obbligatoriamente spedita al Servizio Veterinario, analogamente a quelli per la persona, ma con un rigore decisamente maggiore. Devono essere usati solamente farmaci destinati a quella specie animale e a quella determinata patologia riscontrata dal veterinario; inoltre l'allevatore è tenuto a riportare in un registro ufficiale vidimato dal Servizio Veterinario il farmaco, la data di somministrazione, la forma patologica in causa, il quantitativo e sopratutto l'identificazione precisa degli animali trattati, nonchè il periodo di tempo, indicato dalla ditta produttrice del farmaco, entro il quale non è possibile utilizzare i prodotti derivati dagli animali trattati e nemmeno macellare per uso alimentare l'animale.
L'azione di controllo svolta dal Servizio Veterinario consiste appunto nell'esaminare le ricette che pervengono, controllare i registri di allevamento, sorvegliare il circuito commerciale dei farmaci, anche quando essi sono forniti mescolati all'alimento o all'acqua da bere, eseguire controlli sulle carni e sui prodotti di origine animale per escludere la presenza di tali molecole.
I prodotti rinvenuti e le carni macellate quando ancora non sia passato l'obbligatorio periodo di sospensione dopo il trattamento sono distrutti.

Ai provvedimenti restrittivi sopra segnalati non sono soggetti i farmaci per cani e gatti, che tuttavia sono commercializzati solo dietro presentazione di ricetta veterinaria.

Per informazioni dettagliate sul complesso argomento si consiglia di contattare il Servizio Veterinario.